В 5 часов утра 16 апреля 1945 года началась артиллерийская подготовка, после которой советские войска перешли в наступление на столицу нацистской Германии - Берлин. В ходе Берлинской наступательной операции советские войска разгромили более 100 различных соединений противника, взяв в плен около 480 тысяч солдат и офицеров.
В боях на Берлинском направлении Красной Армии помогали воинские части войск НКВД Управления охраны тыла фронтов. В составе войск 1-го и 2-го Белорусских, а также 1-го Украинского фронтов действовало 13 полков войск НКВД охраны тыла армии, а также четыре стрелковые дивизии войск НКВД. Основной задачей военнослужащих стало проведение мероприятий по обезвреживанию действовавших в тылу наступающих советских войск опасных элементов, будь то «фольксштурмовцы», разрозненные солдаты и офицеры разбитых воинских частей немецкого вермахта, разведывательная и диверсионная агентура нацистов. Войска НКВД также помогли частям Красной Армии и в боестолкновениях. Только в полосе 1-го Белорусского фронта с боями воинами-чекистами было обезврежено более 20 тысяч военнослужащих немецкого вермахта.
В боях на подступах к Берлину при оказании помощи войскам Красной Армии в ликвидации окруженной группировки противника части войск НКВД проявили отвагу и мужество. К тому времени в лесах юго-восточнее Берлина были блокированы до 15 дивизий немецких 9-й и 4-й танковой армий. В них насчитывалось около 200 тысяч солдат и офицеров, более 2 тысяч орудий и минометов, свыше 300 танков и штурмовых орудий.
333-й полк войск НКВД в период проведения Берлинской наступательной операции в боестолкновениях с противником уничтожил 48 и взял в плен 84 гитлеровца. При этом 772 военнослужащих вермахта сдались без сопротивления. 1-2 мая 1945 года военнослужащие 2-го батальона 157-го Краснознаменного полка войск НКВД полка участвовали в блокировании и разоружении группировки войск противника численностью 8 - 12 тысяч человек с танками и артиллерией, пытавшейся в районе Шпандау прорваться на запад и сдаться армии союзников. 2-3 мая 1945 года в пригороде Берлина Мюлленбеке военнослужащие 38-го Краснознаменного и 127-го Померанского полков войск НКВД проводили боевые операции по обезвреживанию пытавшихся вырваться из Берлина гитлеровцев, в результате чего было уничтожено 94 солдата и офицера противника, после этого оставшаяся группировка, насчитывавшая 165 гитлеровцев, решила сдаться в плен. А 4 мая в другом пригороде, Нойгартене, удалось обнаружить лагерь бежавших из Берлина гитлеровцев в количестве 109 солдат, 3 офицеров и одного гражданского, служившего в вермахте.
105-й Рижский полк войск НКВД в боевых порядках 5-й ударной армии вошёл в Берлин с восточной стороны и участвовал в штурме рейхстага. Его военнослужащие первыми вошли в кабинет Гитлера и его бомбоубежище, где фюрер часто проводил свои совещания. Позже именно одна из застав 105-го полка взяла под охрану всю имперскую канцелярию. В Карлхорсте полк вёл охрану здания военно-инженерного училища, где происходило подписание акта о капитуляции.
Эти и другие воинские части войск НКВД внесли значительный вклад в разгром противника. Их заслуги на поле боя были оценены высшим руководством страны. Указами Президиума Верховного Совета СССР 105-й Рижский полк войск НКВД был награжден орденом Красного Знамени, 331-й полк — орденом Богдана Хмельницкого 2-й степени, 38-й Краснознаменный полк — орденом Суворова 3-й степени, 127-й Померанский полк — орденом Кутузова 3-й степени, 157-й Краснознаменный полк - орденом Александра Невского, 107-я отдельная маневренная группа и 108-я отдельная рота связи - орденом Красной Звезды. А 333-й полк войск НКВД был награжден дважды — орденом Кутузова 3-й степени за прорыв обороны немцев при наступлении на Берлин и орденом Красной Звезды за взятие самого города.
После окончания Великой Отечественной войны оставшиеся на территории Германии воинские части войск НКВД приступили к восстановлению безопасности и правопорядка на территории советской зоны оккупации послевоенной Германии. Некоторые воинские части возвратились на Родину уже в конце 1945 года, однако их не ожидала спокойная служба. Героям боев за Берлин вновь пришлось штурмовать укрепления, но не гитлеровцев, а их идейных последователей - украинских националистов. Из состава героических покорителей столицы нацистской Германии до сих пор в строю войск правопорядка в г. Красноярск находится отдельная бригада — наследница боевой славы 38-го Краснознаменного ордена Суворова полка войск НКВД охраны тыла 1-го Белорусского фронта.